（一）加強項目預算管理

項目預算在企業研發費用加計扣除至關重要，其中包含了具體項目的支出預算、項目開發期、年度計劃支出預算以及項目支出總預算等。強化預算管理，對企業中的預算開支與實際開支之間的差距進行充分分析，這樣對于高新技術企業在年度研發費用進行核查工作是十分有利的，確認其研發費用是否依據加計扣除的方式來開展抵稅。對高新技術企業加強項目預算管理具有不可或缺的地位，因為企業若想保障長遠發展，項目的預算進行全面管理是可以保障項目獲取利益最大化的基礎，同樣也是企業規避涉稅風險的前提，基于此才會有效的提高高新技術企業的經濟市場中的核心競爭力。

（二）健全企業內控制度

通過對高素質、高專業的稅務人才組建一個高效率的人才團隊，來對企業的稅務進行處理；構建健全的稅務風險管理制度，有效的對信息進行實時了解，進而掌握我國政策方向，同時還要與稅務機關保持良好的交流；增加核算的準確程度，與研發部門進行及時溝通，尤其是會計與稅法之間的差異，進而對其差異進行適當調整；強化企業內部審計以及核查力度，對企業的涉稅風險進行嚴格控制?？傊?，我國出臺的具有針對性的稅收優惠政策，這對于我國科技發展具有不可或缺的作用，因此加大對其管理力度，是確保高新技術企業全面長久發展的基礎，提供了良好的前提條件，只有對高新技術企業的管理水平與效率不斷提高，才會有效的對高新技術企業的涉稅風險降低。

（三）強化立項管理

高新技術企業的研發項目是具有一定創新性的，是其享受研發費用加計扣除優惠的前提，所以務必要對立項管理進行強化處理，進而有效防止隨意立項的情況出現。第一，高新技術企業需要對自己的研發項目進行全面論證，驗證其是否具有可行性，進而制定項目計劃書；第二，專門的技術評測部門對其創新性進行充分評估有分析，對其進行深層考察，判定其是否為企業研發作出一定貢獻；第三，確保企業的研發項目是具有創新性能的，進而降低與財務部門的理解發生沖突幾率，防止一些不必要的損失發生。

（四）規范會計核算方法

單獨設立一個研發支出賬戶，對高新技術企業的研發費用進行專賬核算，對其費用進行準確歸集；獨自對產品銷售收入進行核算。新技術服務銷售收入與別的銷售收入進行分開處理，這對于復審或是認定是比較便利，基于此來滿足我國企業所得稅管理規定。只有對會計核算的方法加強規范管理，才會確保高新技術企業的財務處于一個正常的狀態，以此來有效的規避高新技術企業中出現涉稅風險，由于涉稅風險會給企業發展帶來巨大影響，因此企業內部的會計核算的方法進行加強管理是至關重要的，它是提高高新技術企業核心競爭力的基礎。

（五）加強備案管理

高新技術企業是充分享受我國給予的稅務優惠政策，其是屬于備案管理方面的稅務優惠。對于高新技術企業的征收稅率是按照正常的減低到15%的稅率；企業在開發新產品、新工藝、新技術時所需的研發費用需要計算在所得稅的納稅中，對其研發費用加計扣除屬于事后備案，納稅人應該在年度納稅中申請附報或是一些其他的有關備案資料，當通過納稅機關審核以后對其進行備案登記。所以高新技術企業需要對備案管理進行高度重視，以此來保障備案的準確、完整以及運用效率。